Bantuan pendidikan ditujukan kepada masyarakat yang bermukim di sekitar Jalan Tol Jasa Marga melalui perbaikan fisik seperti sarana gedung sekolah yang rusak beserta peralatan dan meja kursinya, maupun yang sifatnya non fisik seperti beasiswa.

Selama tahun 2008, untuk bidang Pendidikan Jasa Marga telah merealisasi bantuan sebesar Rp 1,12 milyar, yang selain digunakan untuk beasiswa, juga digunakan untuk membantu merenovasi beberapa sekolah yang berlokasi di sekitar jalan tol, antara lain Sekolah Dasar di Deli Serdang Medan dan di Desa Balas Klumprik Surabaya.

Untuk program pelatihan, Jasa Marga menyelenggarakan pembinaan mental dan spiritual untuk para remaja, salah satunya adalah pelatihan ESQ untuk siswa SMA serta pelatihan keterampilan keahlian kerja untuk anggota Karang Taruna di Jakarta Timur. Selain itu Jasa Marga juga telah menyelenggarakan Program Pendidikan D4 Pengoperasian Jalan Tol yang terakreditasi sejak tahun 2002. Program ini telah menghasilkan lulusan siap pakai guna mendukung perkembangan industri jalan tol secara nasional.

Program Pendidikan D4 tersebut antara lain mempelajari aspek bisnis dan aspek teknis pengoperasian jalan tol. Penyelenggaraan program ini merupakan sumbangan nyata Jasa Marga bagi dunia pendidikan khususnya dalam menciptakan lulusan siap pakai yang dapat langsung diserap oleh sektor industri jalan tol.